Andere fiscale en niet-fiscale taken van de douane.

Accijns, verbruiksbelasting, anti-dumping heffing, landbouwheffing en restitutie,  

Naast invoerrechten en BTW heft de douane ook accijns. De douane is niet alleen verantwoordelijk voor de heffing van accijns bij invoer. Ook als er in Nederland accijnsproducten worden geproduceerd, heft de douane de accijns. Accijns wordt geheven over: alcoholische dranken, brandstoffen zoals benzine, diesel, en tabak en rookwaren. Daarnaast heft de douane ook verbruiksbelasting op alcoholvrije dranken. De landbouw is een van de meest gereguleerde sectoren van de economie. Om de interne Europese markt te beschermen zijn er heffingen op de invoer van allerlei landbouwproducten. Om de Europese landbouw anderzijds op de wereldmarkt te laten concurreren, is er ook landbouw restitutie bij de uitvoer van allerlei landbouwproducten. De landbouwheffing en restitutie is soms zeer hoog. Op de invoer en uitvoer van landbouwgoederen vinden dan ook zeer strenge controles plaats. Soms is de heffing van invoerrechten onvoldoende om de Europese markt voor goedkope import te beschermen. Het komt voor dat bepaalde landen hun industrie financieel steunen om de export van specifieke producten extra concurrerend te maken. De goederen worden dan op de wereldmarkt gedumpt, waardoor andere producenten niet eerlijk kunnen concurreren. Dit komt bijvoorbeeld wel eens voor met bepaalde roestvrijstalen schroeven uit het Verre Oosten. Als een Europese producent van roestvrijstalen schroeven dit merkt, kan hij de Europese Commissie verzoeken een anti-dumping heffing op te leggen. Zo'n anti-dumping heffing kan zeer hoog zijn, tot wel enkele tientallen procenten. Het is logisch dat de douane zeer streng controleert bij de invoer van dergelijke goederen.

Veiligheid, gezondheid, economie en milieu: VGEM

De douane heeft ook een aantal niet-fiscale taken.  Die worden tegenwoordig samengevat onder de afkorting ‘VGEM'. Dit staat voor Veiligheid, gezondheid, economie en milieu. De douane ziet er bijvoorbeeld op toe dat geen gevaarlijk vuurwerk Nederland binnenkomt.  De douane speelt ook een rol in het voorkomen dat goederen worden binnengebracht die gevaarlijk kunnen zijn voor de gezondheid van mens en dier. Dat doet ze veelal samen met andere overheidsorganisaties op het gebied van voedselgezondheid e.d. Op het gebied van de economie moet de douane er op letten dat er bij voorbeeld geen namaak artikelen van merkproducten worden ingevoerd. Om het milieu te beschermen ziet de douane er op toe dat er geen gevaarlijke stoffen worden ingevoerd, zoals bijvoorbeeld cadmium in plastic producten en nog veel meer.  Het aantal niet-fiscale taken van de douane neemt toe. Zo zal met name in de komende jaren het toezicht op de veiligheid sterk worden uitgebreid. Om dit te bereiken zullen bedrijven die betrokken zijn bij de internationale handel worden gecertificeerd als Authorised Economic Operator, kort AEO. Deze certificering wordt een van de belangrijkste niet-fiscale taken van de douane in de komende jaren.